Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COG7P83436 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COG7P83436 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG7P83436 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG7P83436 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms