Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms