Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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