Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1P60507 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms