Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABP4P57796 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABP4P57796 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms