Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms