Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms