Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME5P56597 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME5P56597 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms