Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms