Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPAP53621 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPAP53621 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPAP53621 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms