Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms