Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSEN1P49768 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms