Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTPAP49638 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTPAP49638 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTPAP49638 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTPAP49638 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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