Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTBP49356 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNTBP49356 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNTBP49356 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNTBP49356 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms