Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNTAP49354 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms