Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms