Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms