Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GJC1P36383 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJC1P36383 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms