Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHC1P29353 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHC1P29353 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms