Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCAP28676 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCAP28676 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCAP28676 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCAP28676 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCAP28676 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms