Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms