Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYF6P23409 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYF6P23409 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYF6P23409 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYF6P23409 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms