Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms