Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALB2P22676 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms