Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1P21675 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1P21675 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1P21675 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1P21675 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms