Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms