Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPI1P17947 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms