Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXB4P17483 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXB4P17483 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXB4P17483 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXB4P17483 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXB4P17483 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXB4P17483 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB4P17483 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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