Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IFITM1P13164 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
IFITM1P13164 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms