Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms