Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms