Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L5P0DN76 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms