Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC172P0C7W6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms