Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGAVP06756 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms