Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG5P05408 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG5P05408 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms