Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCATP04180 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCATP04180 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCATP04180 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCATP04180 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms