Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms