Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINA1P01009 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms