Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPLNO95428 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPLNO95428 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms