Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP2O75323 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms