Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPLO60437 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPLO60437 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPLO60437 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPLO60437 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPLO60437 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPLO60437 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPLO60437 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPLO60437 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms