Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSNA1O43805 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSNA1O43805 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSNA1O43805 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSNA1O43805 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSNA1O43805 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms