Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DENRO43583 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DENRO43583 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DENRO43583 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DENRO43583 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms