Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA2O43464 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms