Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APAF1O14727 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms