Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F3O00716 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F3O00716 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms