Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms