Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms