Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM200CA6NKL6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM200CA6NKL6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms