Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85CA6NKD9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85CA6NKD9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85CA6NKD9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85CA6NKD9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85CA6NKD9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85CA6NKD9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85CA6NKD9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms